Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms