Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM5Q9C035 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms