Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM54Q9BYV2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM54Q9BYV2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms