Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HDAC8Q9BY41 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms