Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BPIFA3Q9BQP9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BPIFA3Q9BQP9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms