Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL1Q99990 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms