Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP2Q96SN8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms