Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUDCD1Q96RS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUDCD1Q96RS6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms