Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UIMC1Q96RL1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms