Protein–RNA interactions for Protein: Q96PC3

AP1S3, AP-1 complex subunit sigma-3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S3Q96PC3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S3Q96PC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms