Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC43Q96MW1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms