Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPZA3Q96KX2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms