Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TPD52L3Q96J77 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms