Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZC2HC1AQ96GY0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms