Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCANQ96GW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BCANQ96GW7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms