Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXO17Q96EF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms