Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPTSSAQ969W0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTSSAQ969W0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms