Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP13Q92995 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP13Q92995 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP13Q92995 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP13Q92995 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP13Q92995 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP13Q92995 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP13Q92995 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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