Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RGP1Q92546 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms