Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF397Q8NF99 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms