Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNBD1Q8NA66 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNBD1Q8NA66 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms