Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYT9Q86SS6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYT9Q86SS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms