Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE3BQ7Z3V4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms