Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX7Q7RTT5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX7Q7RTT5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms