Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00299Q6ZSB3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms