Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO3Q6UWJ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms