Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL1Q5VZK9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms