Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHIC1Q5VXU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC1Q5VXU3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC1Q5VXU3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms