Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWA5B1Q5TIE3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VWA5B1Q5TIE3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms