Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYT6Q5T7P8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms