Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C10orf55Q5SWW7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms