Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39P5Q59GN2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms