Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL12Q53G59 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL12Q53G59 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms