Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX19Q49B96 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms