Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KRTAP20-2Q3LI61 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms