Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYSND1Q2T9J0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms