Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPP1R3AQ16821 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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