Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDK4Q16654 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms