Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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VAMP3Q15836 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VAMP3Q15836 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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