Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC85BQ15834 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms