Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC10A1Q14973 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC10A1Q14973 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms