Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB39AQ14964 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms