Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD9Q14511 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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