Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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