Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL3Q13618 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL3Q13618 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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