Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SCGB2A2Q13296 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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