Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms