Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME3Q13232 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME3Q13232 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME3Q13232 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NME3Q13232 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME3Q13232 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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