Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ECH1Q13011 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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