Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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TRAF2Q12933 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF2Q12933 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF2Q12933 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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